元々は西表国立公園という名称だったが、2007年8月1日に石垣島の一部が編入されるとともに、今の西表石垣国立公園に改称された。この公園には特別天然記念物のイリオモテヤマネコ、カンムリワシ、天然記念物のセマルハコガメ、リュウキュウキンバト等の希少な生物種などが生息しており、また石垣島にはラムサール条約登録湿地である、名蔵アンパル・吹通川のマングローブ林・於茂登岳のヤエヤマヤシやカンヒザクラの自生地などの希少な植物がみられる。

周辺海域には白保海域をはじめとするサンゴ礁の海域があり、平久保・米原・川平石崎・白保の4地区が海中公園地区に指定されている。また、西礁湖は360種以上のサンゴが確認され世界的にも貴重なサンゴ礁のひとつである。

マイの振袖